小晋机床切削液在长期使用后会产生大量乳化油渣和金属碎屑，油水分离器的过滤层一旦被堵塞，乳化液的循环效果就会明显下降，刀具磨损加快，工件表面粗糙度也不达标。当分离器效率低于设计值的七成时，就该安排手动清洗了。清洗周期一般控制在两到四周一次，具体取决于机床的加工强度和切削液类型——铁屑加工比铝件加工脏得快得多。
动手之前先停机，断开冷却泵的电源，把分离器上方的排油阀打开，让残液自然流尽，再用棉布擦净接口。打开分离器的检修盖，取出内部的聚结滤芯或陶瓷分离盘。滤芯如果是无纺布材质，泡在专用清洗剂里浸泡二十分钟，然后用高压气枪从内向外吹扫，吹出的废液别往地上洒，直接接到废液桶里。陶瓷分离盘用软毛刷刷洗，注意别用金属丝刷，盘面一旦划伤，聚结效果就废了。如果分离盘表面有顽固的皂化层，用稀释的氢氧化钠溶液（浓度控制在5%左右）浸泡后轻刷即可。
清洗完装回之前有个容易忽略的环节——检查密封垫。橡胶O型圈如果发硬或者出现细微裂纹，必须更换，否则安装后会出现漏液，分离腔进水，整个设备就白洗了。密封面还要用无水乙醇擦拭一遍，确保没有残留的切削液或清洗剂。装回时注意滤芯的朝向，聚结面必须朝外，别装反了。拧紧检修盖后先空转泵体十分钟，观察分离腔压力是否稳定，再开冷却液循环，确认油水分离效果恢复正常。
在矿用防爆、矿用隔爆型机床配套的水基冷却系统中，油水分离器的清洗还需特别注意：清洗作业必须在指定防爆区域内进行，不得使用非防爆工具拆卸接口，清洗剂须选用无闪点或低闪点的专用溶剂，避免产生可燃蒸气积聚。清洗产生的废液和废滤芯属于危险废物，应按《国家危险废物名录》要求交由有资质的单位处理，不能随意倾倒。
